Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SptbP15508 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SptbP15508 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SptbP15508 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SptbP15508 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms