Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpsaP14206 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RpsaP14206 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms