Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd1P13516 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms