Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FosbP13346 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FosbP13346 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FosbP13346 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FosbP13346 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms