Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MyogP12979 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MyogP12979 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MyogP12979 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MyogP12979 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms