Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms