Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lire1P11260 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lire1P11260 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lire1P11260 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms