Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdh3P10287 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms