Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Schip1P0DPB4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms