Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Pde6gP09174 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pde6gP09174 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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