Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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