Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms