Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms