Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa4P06798 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms