Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa4P06728 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms