Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06324 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06324 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06324 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P06324 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06324 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06324 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06324 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06324 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06324 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06324 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06324 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06324 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06324 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06324 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms