Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06321 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06321 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06321 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06321 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06321 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06321 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06321 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06321 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06321 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06321 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06321 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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