Protein–RNA interactions for Protein: P04345

Cryga, Gamma-crystallin A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygaP04345 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CrygaP04345 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms