Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamc1P02468 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms