Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01852 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01852 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01852 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01852 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01852 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms