Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01740 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01740 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01740 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01740 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01740 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms