Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01679 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01679 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01679 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01679 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01679 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms