Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01661 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01661 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01661 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01661 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01661 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01661 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms