Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dll3O88516 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dll3O88516 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dll3O88516 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms