Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms