Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaskO70589 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms