Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RngttO55236 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RngttO55236 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RngttO55236 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RngttO55236 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RngttO55236 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms