Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChkbO55229 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms