Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms