Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff2O55112 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff2O55112 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms