Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrxO55103 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrxO55103 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrxO55103 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrxO55103 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrxO55103 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms