Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms