Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copb2O55029 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms