Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NlkO54949 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NlkO54949 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NlkO54949 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NlkO54949 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NlkO54949 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NlkO54949 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NlkO54949 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NlkO54949 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NlkO54949 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NlkO54949 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NlkO54949 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NlkO54949 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NlkO54949 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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