Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs5O54928 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Socs5O54928 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms