Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2f6O54917 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2f6O54917 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2f6O54917 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2f6O54917 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms