Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a2O54833 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms