Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek2O35942 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek2O35942 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms