Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CaluO35887 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CaluO35887 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CaluO35887 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CaluO35887 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CaluO35887 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaluO35887 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms