Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhx8O35652 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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