Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms