Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Edil3O35474 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edil3O35474 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms