Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pld3O35405 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms