Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Smad7O35253 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Smad7O35253 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Smad7O35253 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smad7O35253 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms