Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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