Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CenpaO35216 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms