Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms