Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms