Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms