Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn4O35054 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn4O35054 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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